Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bcl11bQ99PV8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Bcl11bQ99PV8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bcl11bQ99PV8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms