Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms