Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt23Q99PS0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms