Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim12aQ99PQ1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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