Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd3Q99PL7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms