Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Rrbp1Q99PL5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms