Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab27bQ99P58 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms