Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl43Q99N89 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms