Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms