Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdac9Q99N13 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms