Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Epdr1Q99M71 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epdr1Q99M71 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms