Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nus1Q99LJ8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms