Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cstf3Q99LI7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms