Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sh3bp5lQ99LH9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms