Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q99KU6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q99KU6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q99KU6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q99KU6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q99KU6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q99KU6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q99KU6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q99KU6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q99KU6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q99KU6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q99KU6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q99KU6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q99KU6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q99KU6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q99KU6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q99KU6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q99KU6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q99KU6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q99KU6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q99KU6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q99KU6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q99KU6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q99KU6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q99KU6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q99KU6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q99KU6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q99KU6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q99KU6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q99KU6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q99KU6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q99KU6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q99KU6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q99KU6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q99KU6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q99KU6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q99KU6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q99KU6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q99KU6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q99KU6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q99KU6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q99KU6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q99KU6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q99KU6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Q99KU6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q99KU6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q99KU6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q99KU6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q99KU6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q99KU6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q99KU6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q99KU6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q99KU6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q99KU6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q99KU6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q99KU6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q99KU6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q99KU6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q99KU6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Q99KU6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q99KU6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q99KU6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q99KU6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Q99KU6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q99KU6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q99KU6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q99KU6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q99KU6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q99KU6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q99KU6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q99KU6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q99KU6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q99KU6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q99KU6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q99KU6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q99KU6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q99KU6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q99KU6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q99KU6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q99KU6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q99KU6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q99KU6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q99KU6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q99KU6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q99KU6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q99KU6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q99KU6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q99KU6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q99KU6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q99KU6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q99KU6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q99KU6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q99KU6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q99KU6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q99KU6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q99KU6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q99KU6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q99KU6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q99KU6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q99KU6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms