Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf34Q99KR6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms