Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lactb2Q99KR3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms