Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lims1Q99JW4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms