Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf144aQ925F3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms