Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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