Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b5Q923D4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b5Q923D4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b5Q923D4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b5Q923D4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b5Q923D4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b5Q923D4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b5Q923D4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b5Q923D4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b5Q923D4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b5Q923D4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b5Q923D4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b5Q923D4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3b5Q923D4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3b5Q923D4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3b5Q923D4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3b5Q923D4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms