Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim59Q922Y2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms