Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Clip1Q922J3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Clip1Q922J3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms