Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pde6cQ91ZQ1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pde6cQ91ZQ1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pde6cQ91ZQ1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pde6cQ91ZQ1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pde6cQ91ZQ1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pde6cQ91ZQ1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pde6cQ91ZQ1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pde6cQ91ZQ1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pde6cQ91ZQ1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pde6cQ91ZQ1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pde6cQ91ZQ1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pde6cQ91ZQ1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde6cQ91ZQ1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde6cQ91ZQ1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde6cQ91ZQ1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde6cQ91ZQ1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde6cQ91ZQ1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde6cQ91ZQ1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde6cQ91ZQ1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Pde6cQ91ZQ1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde6cQ91ZQ1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde6cQ91ZQ1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Pde6cQ91ZQ1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Pde6cQ91ZQ1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Pde6cQ91ZQ1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Pde6cQ91ZQ1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Pde6cQ91ZQ1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Pde6cQ91ZQ1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Pde6cQ91ZQ1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Pde6cQ91ZQ1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Pde6cQ91ZQ1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Pde6cQ91ZQ1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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