Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms