Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd3Q91WC0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms