Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usb1Q91W78 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms