Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Csde1Q91W50 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms