Protein–RNA interactions for Protein: Q91VS8

Farp2, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp2Q91VS8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Farp2Q91VS8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Farp2Q91VS8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Farp2Q91VS8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Farp2Q91VS8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Farp2Q91VS8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Farp2Q91VS8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Farp2Q91VS8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms