Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SelenomQ8VHC3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms