Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms