Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc115Q8VE99 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms