Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms