Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep57l1Q8VDS7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep57l1Q8VDS7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep57l1Q8VDS7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep57l1Q8VDS7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep57l1Q8VDS7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep57l1Q8VDS7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep57l1Q8VDS7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep57l1Q8VDS7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep57l1Q8VDS7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cep57l1Q8VDS7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cep57l1Q8VDS7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cep57l1Q8VDS7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cep57l1Q8VDS7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cep57l1Q8VDS7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cep57l1Q8VDS7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms