Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDM1

Zgpat, Zinc finger CCCH-type with G patch domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZgpatQ8VDM1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZgpatQ8VDM1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZgpatQ8VDM1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZgpatQ8VDM1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms