Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt25Q8VCW2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt25Q8VCW2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms