Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms