Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm4cQ8VCD7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4cQ8VCD7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms