Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC6

Ccm2l, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2lQ8VCC6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccm2lQ8VCC6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccm2lQ8VCC6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccm2lQ8VCC6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccm2lQ8VCC6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccm2lQ8VCC6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccm2lQ8VCC6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccm2lQ8VCC6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccm2lQ8VCC6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccm2lQ8VCC6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccm2lQ8VCC6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccm2lQ8VCC6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccm2lQ8VCC6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccm2lQ8VCC6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccm2lQ8VCC6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccm2lQ8VCC6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccm2lQ8VCC6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccm2lQ8VCC6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccm2lQ8VCC6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccm2lQ8VCC6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccm2lQ8VCC6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2lQ8VCC6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms