Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops8Q8VBV7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops8Q8VBV7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops8Q8VBV7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops8Q8VBV7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops8Q8VBV7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops8Q8VBV7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops8Q8VBV7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops8Q8VBV7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cops8Q8VBV7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops8Q8VBV7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops8Q8VBV7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops8Q8VBV7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops8Q8VBV7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops8Q8VBV7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops8Q8VBV7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops8Q8VBV7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops8Q8VBV7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops8Q8VBV7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops8Q8VBV7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops8Q8VBV7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops8Q8VBV7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cops8Q8VBV7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms