Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ApobrQ8VBT6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms