Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hecw1Q8K4P8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms