Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdk5rap2Q8K389 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk5rap2Q8K389 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms