Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms