Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trappc12Q8K2L8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc12Q8K2L8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms