Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1eQ8K202 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms