Protein–RNA interactions for Protein: Q8K199

Cmc2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc2Q8K199 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmc2Q8K199 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmc2Q8K199 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmc2Q8K199 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmc2Q8K199 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmc2Q8K199 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Cmc2Q8K199 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Cmc2Q8K199 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmc2Q8K199 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Cmc2Q8K199 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Cmc2Q8K199 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Cmc2Q8K199 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Cmc2Q8K199 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Cmc2Q8K199 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Cmc2Q8K199 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Cmc2Q8K199 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmc2Q8K199 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms