Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700001C19RikQ8K168 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
1700001C19RikQ8K168 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms