Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip10Q8CJ53 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip10Q8CJ53 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip10Q8CJ53 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip10Q8CJ53 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Trip10Q8CJ53 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trip10Q8CJ53 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trip10Q8CJ53 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trip10Q8CJ53 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip10Q8CJ53 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trip10Q8CJ53 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trip10Q8CJ53 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trip10Q8CJ53 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trip10Q8CJ53 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip10Q8CJ53 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip10Q8CJ53 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip10Q8CJ53 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms