Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syne4Q8CII8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms